Standardmetoder for eksempel microarrays og bulk RNA-seq-undersøgelse analyserer ekspressionsformen af RNA'er fra store populationer af celler. I blandede cellepopulationer kan disse målinger skjule kritiske forskelle mellem individuelle celler inden for disse populationer.
Enkeltcelle RNA -sekventering( scRNA-seq) tilvejebringer formen for ekspressionsprofiler af individuelle celler. På trods af det er det ikke muligt at opnå fuldstændig information om hver RNA udtrykt af hver celle på grund af den lille mængde tilgængeligt materiale, mønstre af genudtryksform kan identificeres gennem genklyngeanalyser. Dette kan støde på eksistensen af sjældne celletyper i en cellepopulation, der måske aldrig er blevet set før. For eksempel blev sjældne specialiserede celler i lungen kaldet pulmonale ionocytter, der udtrykker cystisk fibrose-transmembranekonduktansregulator, identificeret i 2018 af to grupper, der udførte scRNA-Seq på lungesystemvejsepithelia.
Billede 260A | Sammenligning af enkeltcellemetyleringssekvenseringsmetoder med hensyn til dækning pr. 2015 på Mus musculus | Matthias Farlik4, Nathan C. Sheffield4, Angelo Nuzzo, Paul Datlinger, Andreas Schönegger, Johanna Klughammer, Christoph Bock / Attribution 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Comparison_of_single_cell_methylation_sequencing_methods_in_terms_of_coverage_as_at_2015.png) from Wikimedia Commons
Forfatter : Yavor Mendel
Kommentarer
Send en kommentar