Strukturforudsigelse og beregningsmæssig antistofdesign

Antistoffernes betydning i sundhedsvæsenet og bioteknologibranchen kræver viden om deres strukturer i høj opløsning. Denne information bruges til proteinteknik, modificering af antigenbindingsaffinitet og identifikation af en epitop af et givet antistof. Røntgenkrystallografi er en klart anvendt handling til bestemmelse af antistofstrukturer. Selvom krystallisering af et antistof ofte er mødende og tidskrævende. Beregningsmetoder giver et billigere og hurtigere alternativ til krystallografi, men deres resultater er mere tvetydige, da de ikke producerer empiriske strukturer. Online webservere som illustreret af Web Antibody Modelling (WAM) og Prediction of Immunoglobulin constitution (PIGS) muliggør beregningsmodellering af antistof-variable regioner. Rosetta Antistof er et nyt antistof F V region konstitution forudsigelsesserver, der inkorporerer sofistikerede teknikker til at minimere CDR-løkker og optimere den relative orientering af de lette og tunge kæder, udover som homologimodeller, der forudsiger vellykket docking af antistoffer med deres unikke antigen.

Billede 396A | Mekanisme til rekombination af klasse switch, der tillader isotype switching i aktiverede B celler | EN: Bruger: Ciar / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Class_switch_recombination.png) fra Wikimedia Commons

Billede 396A | Mekanisme til rekombination af klasse switch, der tillader isotype switching i aktiverede B celler | EN: Bruger: Ciar / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Class_switch_recombination.png) fra Wikimedia Commons

Forfatter : Merim Kumars

Referencer:

Medicinsk mikrobiologi II: Sterilisering, laboratoriediagnostik og immunrespons

Molekylær diagnostik i mikrobiologi

Kommentarer