Dynamiske genomer med høj plasticitet er nødvendige for at lade patogener, for det meste bakterier, overleve i skiftende miljøer. Ved hjælp af sekvenseringsmetoder med høj kapacitet og silikoteknologier er det muligt at afsløre, sammenligne og katalogisere mange af disse dynamiske genomiske begivenheder. Genomisk mangfoldighed er vigtig, når detekteres og behandles et patogen, da disse begivenheder kan ændre patogenens service og sammensætning. Der er behov for at analysere mere end et enkelt genomkonsentration af en patogenart for at forstå patogenmekanismer. Sammenlignende genomik er en metode, der giver forskere mulighed for at sammenligne genomerne af forskellige arter og stammer. Der er adskillige eksempler på vellykkede komparative genomikundersøgelser, blandt andet undersøgelsen af Listeria og Escherichia coli. Nogle studier har forsøgt at tackle forskellen mellem patogene og ikke-patogene mikrober. Denne undersøgelse viser sig at være vanskelig, selvom en enkelt bakterieart kan have mange stammer, og det genomiske indhold i hver af disse stammer varierer.
Billede 383A | En microarray -chip indeholder komplementær DNA (cDNA) til mange sekvenser af interesse. CDNA fluorescerer, når det hybridiserer med et matchende DNA fragment i prøven. | National Cancer Institute / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microarray_Comparative_Genomic_Hybridisation.jpg) fra Wikimedia Commons
Forfatter : Merim Kumars
Referencer:
Medicinsk mikrobiologi II: Sterilisering, laboratoriediagnostik og immunrespons
Kommentarer
Send en kommentar