Storskala sekventering og de novo sekventering

Storskala-sekventering sigter ofte mod sekventering af meget lange DNA stykker, som vist ved hele kromosomer, på trods af storskala-sekventering kan på lignende måde bruges til at generere meget stort antal korte sekvenser, som vist i phage display. For længere mål, som vist ved kromosomer, består almindelige fremgangsmåder af skæring (med begrænsningsenzymer) eller forskydning (med mekaniske kræfter) store DNA fragmenter i kortere DNA fragmenter. Det fragmenterede DNA kan derefter klones i en DNA -vektor og amplificeres i en bakterievært som vist af Escherichia coli. Kort DNA fragmenter oprenset fra individuelle bakteriekolonier sekventeres indikativt og samles elektronisk til en lang sammenhængende sammenhængen. Undersøgelser har vist, at tilføjelse af et størrelsesudvælgelsestrin for at opsamle DNA -fragmenter med ensartet størrelse kan forbedre sekventeringseffektiviteten og nøjagtigheden af ​​genomsamlingen. I disse undersøgelser har automatiseret dimensionering vist sig at være mere reproducerbar og præcis end manuel gelstørrelse.

Billede 149A | Et eksempel på resultaterne af automatiseret kædeterminering DNA -sekventering. | Abizar på engelsk Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) fra Wikimedia Commons

Billede 149A | Et eksempel på resultaterne af automatiseret kædeterminering DNA -sekventering. | Abizar på engelsk Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) fra Wikimedia Commons

Forfatter : Milos Pawlowski

Referencer:

Teknikker til molekylærbiologi I

Værktøjer til molekylærbiologi II

Kommentarer