Den første af high-outputput-sekventeringsteknologier, massivt parallelt signatur-sequencing (eller MPSS), blev udviklet i 1990'erne hos Lynx Therapeutics, et firma grundlagt i 1992 af Sydney Brenner og Sam Eletr. MPSS var en perlebaseret operation, der brugte en complex, der var ved hånden for adapterligering efterfulgt af adapterafkodning, hvor man læste sammenkædningen i trin af fire nukleotider. Denne operation gjorde den modtagelig for sekvensspecifik bias eller tab af specifikke sekvenser. Med den begrundelse, at teknologien var sådan complex, blev MPSS kun udført 'in-house' af Lynx Therapeutics og ingen DNA sekventeringsmaskiner blev solgt til uafhængige laboratorier. Lynx Therapeutics fusionerede med Solexa (senere erhvervet af Illumina) i 2004, hvilket førte til udviklingen af sekventering-ved-syntese, en enklere ved hånden erhvervet fra Manteia Predictive Medicine, der gjorde MPSS forældet. Under alle omstændigheder var de væsentlige egenskaber ved MPSS-output typiske for senere datatyper med høj kapacitet, inklusive hundretusinder af korte DNA -sekvenser. I tilfælde af MPSS blev disse sædvanligvis anvendt til sekventering af cDNA til måling af genform af ekspressionsniveauer.
Billede 151A | Flere, fragmenterede sammenkædingsanalyser skal samles på grundlag af deres overlappende områder. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) fra Wikimedia Commons
Forfatter : Milos Pawlowski
Kommentarer
Send en kommentar