Ribosome profilering, eller Ribo-Seq (også kaldet ribosom-fodaftryk), er en tilpasning af en teknik udviklet af Joan Steitz og Marilyn Kozak for næsten 50 år siden, som Nicholas Ingolia og Jonathan Weissman tilpassede til at arbejde med næste generations sekvensering, der bruger specialiseret messenger RNA (mRNA) -sekventering for at bestemme hvilke mRNA'er, der aktivt oversættes. Det producerer et "globalt snapshot" af alle ribosomer, der er aktive i en celle i et bestemt øjeblik, kendt som et translatom. Konkluderende giver dette forskere mulighed for at afsløre placeringen af oversættelsesstartsteder, komplementet af oversatte ORF'er i en celle eller væv, fordelingen af ribosomer på en messenger RNA og hastigheden for at oversætte ribosomer. Ribosome profilering involverer lignende sekventering af biblioteksforberedelse og dataundersøgelse som RNA-Seq, men i modsætning til RNA-Seq, som sekvenserer hele mRNA'et i en given sammenkædning, der er til stede i en prøve, målretter ribosomprofilering kun mRNA-sekvenser beskyttet af ribosomet under handlingen med afkodning ved oversættelse. Denne teknik adskiller sig fra polysom profilering.
Billede 251A | Ribosome Kort profilering | DennisPietras / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:RibosomeProfilejpg.jpg) from Wikimedia Commons
Forfatter : Yavor Mendel
Kommentarer
Send en kommentar