SnRNA-seq bruger isolerede kerner snarere hele cellerne til profilering af genudtryksform. Det vil sige, scRNA-seq måler både cytoplasmatiske og nukleare transkripter, på den anden side snRNA-seq måler naturligvis nukleare transkripter (skønt nogle transkriptsstyrke er knyttet til den grove endoplasmatiske reticulum og delvist bevaret i nukleare præparater). Dette gør det muligt for snRNA-seq kun at fortsætte kernen og ikke hele cellen. Af denne grund sammenlignet med scRNA-seq er snRNA-Seq mere passende til at profilere genet form for ekspression i celler, der er vanskelige at isolere (f.eks. Adipocytter, neuroner), udover som konserverede væv.
Derudover kan de kerner, der kræves til snRNA-seq, opnås hurtigt og let fra friske, let fikserede eller frosne væv, mens isolering af enkeltceller til enkeltcelle RNA-seq( scRNA-seq) involverer udvidede inkubationer og behandling. Dette giver forskerne dygtighed til at opnå transkriptomer, som ikke er så forstyrrede under isolering.
Billede 271A | Grundlæggende snRNA-Seq-eksperimenter, der ikke bruger en DroNC-Seq-arbejdsgang, ville følge en protokol, der ligner denne | Simkrai / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Basic_snRNA-Seq_Workflow.png) from Wikimedia Commons
Forfatter : Yavor Mendel
Kommentarer
Send en kommentar