Software til bioinformatik og design

Anvendelse af plasmider som en teknik i molekylærbiologi understøttes af bioinformatik-software. Disse programmer registrerer DNA sammenkædning af plasmidvektorer, hjælper med at forudsige skærede steder af begrænsningsenzymer og til at planlægge manipulationer. Eksempler på softwarepakker, der håndterer plasmidkort, er ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Vector NTI og WebDSV. Disse stykker software hjælper med at udføre hele eksperimenter i silico, før de udfører våde eksperimenter.

Plasmid samlinger

Mange plasmider er blevet skabt gennem årene, og forskere har uddelt plasmider til plasmiddatabaser, for eksempel de non-profit organisationer Addgene og BCCM / LMBP. Man kan identificere og opfordre plasmider fra disse databaser til forskning. Forskere uploader desuden ofte plasmidsekvenser til NCBI -databasen, hvorfra sekvenser af specifikke plasmider kan hentes.

Billede 239A | En skematisk repræsentation af pBR322 -vektoren med begrænsningssteder angivet i blåt. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

Billede 239A | En skematisk repræsentation af pBR322 -vektoren med begrænsningssteder angivet i blåt. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

Forfatter : Milos Pawlowski

Referencer:

Almindelige molekylærbiologiteknikker II

Værktøjer til molekylærbiologi V

Kommentarer